To ιατρείο Παιδιατρικής Λοιμωξιολογίας είναι μια εξειδικευμένη υπηρεσία για την αξιολόγηση και τη θεραπεία παιδιών και εφήβων που έχουν εκτεθεί ή έχουν προσβληθεί από λοιμώδη νοσήματα. Πραγματοποιείται μια φορά την εβδομάδα (κάθε Τετάρτη 1200-1400 μμ) και παρέχει υπηρεσίες σε περίπου 250 περιστατικά ετησίως. Τα περιστατικά αυτά περιλαμβάνουν:
-παιδιά και εφήβους με λοιμώδη νοσήματα για επανεκτίμηση μετά την έξοδό τους από το νοσοκομείο
-παιδιά με νεοδιαγνωσθείσες λοιμώξεις στην κοινότητα π.χ. γενικά λοιμώδη νοσήματα, συγγενείς λοιμώξεις, φυματίωση, HIV, λοιμώδεις ηπατίτιδες
-παιδιά με υποτροπιάζουσες λοιμώξεις, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που είναι ύποπτα για ανοσοανεπάρκεια.